LeviCell™应用场景 | 助力精准、快速的抗体药物发现流程

2023/04/13

今天小编带来的正是Vanderbilt大学的科研人员通过10X Genomics单细胞测序和Berkeley Lights公司的Beacon®单B细胞筛选平台组合的一套高效快速的mAb发现流程。利用这个流程开发的针对新冠疫情的COVID-19中和抗体药物研发，从立项到III期临床只用了短短的6个月时间，而在传统的杂交瘤和抗体展示技术为主的研发流程里面最快也需要数年的时间。

图一：抗体发现工作流程和时间表。左边是主要基于10X Genomics单细胞测序筛选-基因合成的抗体发现路径，右边是主要基于Berkeley Lights的Beacon®平台的单细胞功能检测和克隆流程。两个路径并行且可以提供可互补的先导物集合。

其实，不论是图一中哪种抗体的发现路径，起始样本中细胞活性和原始表型的保持对于后续的抗体发现来说，都是重要且必需的。实际上，样本中未去除的死细胞或者已经改变原始表型的细胞不仅不能提供有意义的生物学信息，还会造成试剂浪费、通道堵塞以及数据污染等诸多问题。因此，这些精细化的单细胞分析检测平台的流程中，LeviCell™可以提供的高活率、原始表型不变的样本细胞就显得格外珍贵。我们先来回顾一下LeviCell™在提供高活率细胞上的优异表现。

图二：子宫内膜癌组织酶解之后，通过LeviCell™平台进行活细胞富集，从初始的27.5%的活率在两次并行的富集分选后分别提升到了73.08%和88.54%。

图三：膀胱癌组织酶解之后，通过LeviCell™平台进行活细胞富集，从初始的68.8%的活率在两次并行的富集分选后分别提升到了88.19%和90.20%。

从上面两张图展示的LeviCell™的活细胞分选富集的实验中，可以看到癌组织在酶解离之后的活率都处于比较低的水平，这样的样本难以进行下游的单细胞测序或者单细胞功能分析的。但是，经过LeviCell™的分选之后，样本活率都显著提高到可以进行优质下游实验的水平。另外，我们从下面的图四、图五还可以看到，在提高活率的同时，LeviCell™还能很好地保持样本的原始细胞表征，且不会破坏其中各种细胞群所占的比例。

小编注意到，在Vanderbilt大学的快速mAb发现流程中，Beacon单B细胞筛选平台的路径在前导化合物筛选上仅仅用时18天。之所以可以实现如此快速的抗体发现，主要还是因为这种技术无需杂交瘤融合就可以直接筛选来自多种免疫器官的浆细胞，大大缩短了筛选B细胞免疫组库的流程。

图四：子宫内膜癌组织酶解之后，通过LeviCell™平台进行活细胞富集很好的保持了分选前后各个细胞亚群的比例，没有影响样本各细胞类型的原始表征。

图五：膀胱癌组织酶解之后，通过LeviCell™平台进行活细胞富集很好的保持了分选前后各个细胞亚群的比例，没有影响样本各细胞类型的原始表征。

不管是我们较熟悉的单细胞转录组测序scRNA-seq，还是今天介绍的单B细胞免疫组库筛选的Beacon平台，这些热门的新技术手段都是基于单细胞层面开展的细胞基因表达研究。此类精细化的技术对于样本质量的要求往往很高，上样细胞的活性和原始表型的保存对于节省试剂成本、保证实验进程和有效生物学意义的发现都至关重要。但是，传统的样本处理技术往往在活性、得率等方面不尽如人意。而LeviCell™采用独特的无需标记的、温和的细胞分选平台在整个应用的前处理环节应用价值巨大。